В параллельной вселенной Вестройе могущественное существо Бакуган (маленькая магнитная сфера, которая при ударе о Карту Ворот превращается в очень сильного и могущественного война) по имени Нага (Naga) решил поглотить энергию двух зон, сохраняющих равновесие и мир в Вестройе. Однако, он поглотил слишком много силы из Зоны Молчания, источника негативной энергии. В свою очередь, сила Зоны Бесконечности, источника позитивной энергии, была поглощена Бакуганом Вейф (Wavern).
В центре истории находились 6 друзей, которые нашли металлические карты, упавшие на них с неба, или, если быть точным, из самой Вестройи. Семь подростков, Дэн, Шун, Руно, Маручо, Джули, Элис и Джо, объединились в организацию, которую назвали “Отчаянные бойцы Бакуган”. Вместе они узнавали больше о природе Бакуган, Вестройи и придумали стратегическую игру, с использованием Бакуган.